
全基因组测序(WGS)是一种实验室技术,有可能改变我们检测和监测食物链中微生物危害的方式。WGS有助于通过加强常规监测、疫情发现、疫情应对和使用“同一个健康”方法确定食源性疾病的来源,从而了解食源性疾病。鉴于该技术优于以前的低分辨率分型和检测方法,预计该技术将有助于减轻食源性疾病的负担。
因此,世界卫生组织(世卫组织)发布了一项新的指南:“全基因组测序(WGS)作为加强食源性疾病监测和应对的工具”。
本指南由三个模块组成:
模块1,导论模块,解释在考虑实施WGS之前,食源性疾病监测和反应系统的最低能力要求。
模块2,食源性疾病暴发调查中的全基因组测序,讨论了WGS如何用于支持食源性疾病暴发调查。
模块3,全基因组测序在食源性疾病常规监测中的应用,介绍了WGS在食源性疾病常规监测中的应用。
这些文件提供了关于将WGS作为食源性疾病监测和应对工具所需能力的指导,总结了实施WGS的选择,并解释了如何将WGS整合到现有系统中。