热点;nsored有限公司Arxspan提供的内容的见解来自工业界的adrienne Lemieux
赵应
丹尼尔·詹姆斯
SciY由四个不同的公司组成，由一个共同的愿景统一。首先，我们有Arxspan，一个为管理科学数据而设计的完全集成的云平台。这个平台将化学和生物数据无缝地合并到一个统一的系统中。
接下来，我们有Mestrelab Research，它通过其Mgears应用程序提供分析数据处理、分析、可视化和报告，以及分析工作流自动化。它还专注于将软件连接到仪器上。
接下来，还有Zontal，这是一个符合gxp标准的云平台，用于集成数字实验室，具有生命科学分析和长期数据保存功能。最后，我们有Optimal，它提供实时过程控制的PAT软件解决方案，以及定制的自动化，机械和集成服务。
通过SciY，我们建立了一个独特的供应商生态系统，通过公平的数据平台无缝集成，为广泛的实验室和制造环境实现数字化转型。
Arxspan是一个完全集成的科学数据管理云平台，将化学和生物数据结合在一个系统中。它旨在加强内部团队和外部合作伙伴之间的合作研究。
电子实验室笔记本，简称ELN，完全是基于网络的。它易于使用，可以在几分钟内部署到全球。它具有科学的嵌入式工作流解决方案，同时能够与其他系统和软件以及内置基础设施和数据安全集成。这允许内部和外部共享数据，并且还遵循法律和法规遵从性。
这也与我们的注册应用程序集成，使独特的化学和生物实体能够注册。ELN还可以选择链接到我们的库存，以便您可以跟踪和管理任何实物项目。
Arxspan的资产应用程序允许用户定义、收集、管理和存储资产端点数据。这是理想的资产开发功能和低通量和高通量筛选。所有这些数据都可以使用我们的搜索和报告应用程序组合在一起。
Arxspan BioDrive是我们完整的分子生物学解决方案，已集成到Arxspan ELN中。
Arxspan BioDrive是一个独特的平台，使分子生物学家能够解决他们领域的各种挑战。客户可以在实验的配置中加入特定的要求，以满足他们独特的需求。BioDrive以其独特的功能，提供了流畅的分子生物学工作流程。其高效的设计和友好的导航增强了整体用户体验。
BioDrive通过自动将序列加载为双链DNA并生成相应的序列图来简化序列处理。
但是，为了获得更大的灵活性，您可以选择RNA选项。当您选择RNA时，BioDrive允许您将序列加载为单链或双链RNA。如果你装载单链RNA，序列图将只显示前链。
此外，BioDrive具有方便的功能，使您能够将DNA转化为RNA。你可以选择正链或反链将其转化为单链RNA。如果你选择两条链，RNA将生成双链。
此外，BioDrive还提供了模拟剪接反应或去除带注释内含子的独特功能。例如，如果你的初始序列包含内含子被外显子包围，BioDrive可以去除内含子并将外显子无缝连接在一起，从而形成新形成的单链RNA。
在BioDrive，管理引物是毫不费力地通过手动添加或导入选项。要手动添加引物，只需选择您打算放置引物的序列区域。专门的引物面板允许您指定名称，指定它是RNA还是DNA寡核苷酸，并选择其在正向链或反向链上的方向。
此外，你可以定制你的底漆添加一个摇摆尾巴。例如，您可以添加带有特定酶识别位点(如XhoI)的六核苷酸尾部。通过复制和粘贴序列，您可以无缝地将识别位点集成到引物中。这种修改在地图上直观地表示为附着在引物上的悬挂尾巴。
此外，BioDrive使您能够进行精确的更改，如切换氨基酸或密码子。结合位点分析功能使您能够评估引物在DNA序列中的结合潜力。您可以定义参数并让系统计算结合，帮助您确定特定的结合位置或潜在的启动位点。
或者，您可以从CSV文件导入引物。该系统允许您自定义参数，如不匹配，熔化温度(Tm)和GC含量。计算之后，您将看到可以进一步优化的多个选项。BioDrive为您提供了修改参数、重新计算和缩小选择范围的灵活性。一旦你选择了所需的引物，你就可以无缝地将其整合到你的序列中。
为了确保引物的完整性，BioDrive提供了引物分析功能。通过选择actions下面的“引物分析”，可以检查单个引物的二级结构。如果你需要评估引物二聚体，你可以分析正向引物与反向引物配对。结果页提供了对同型二聚体的能量和形成的见解。
对于以特定区域为目标的研究人员，BioDrive提供了一个全面的“创建引物设计”功能。在这里，您可以定义目标区域、产品尺寸和Tm范围等参数。点击“设计”后，BioDrive会生成引物对选项列表，其中包含详细信息，包括位置、TM和GC内容。这个详细的概述使您能够根据您的研究要求做出明智的决定。
在BioDrive中，我们提供了两个以类似方式运行的客户库:feature库和oligo库。
特性库使您能够手动创建注释特性集合。您可以单独添加这些特性，也可以使用import函数引入预先存在的注释特性列表。类似地，oligo库允许您管理引物或引导序列。您可以灵活地手动添加它们或将它们导入库。
一旦用序列填充了oligo库，就可以利用“检测oligos”函数。此功能扫描目标序列并自动将互补oligo添加到项目中。在“检测oligo”操作中，您可以自定义参数并从选择的oligo中选择添加到场景中。
有了BioDrive的校准功能，您可以灵活地评估针对目标序列的测序文件或直接比较两个序列。
您可以通过将多个MBI文件拖放到平台上来无缝加载它们，从而允许同时对齐。排列的序列并排显示，任何不匹配的核苷酸数据都以红色突出显示。这个视觉提示有助于识别差异，然后您可以选择特定的跟踪并对对齐进行评分，以便进一步分析。
或者，您可以使用比对文件，例如删除GenBank文件，来比较两个DNA序列。在比较同源但经过修改的序列时，这种功能被证明是无价的。同样，序列之间的任何差异都用红色突出显示，在产品序列之间的差异提供了清晰的视觉区分。
在BioDrive中，通过重新索引功能，管理环状DNA序列和线性序列变得毫不费力。对于环状DNA，如果希望改变圆的初始点，可以使用重新索引函数输入原点的新位置。类似地，如果需要对线性序列重新编号，也可以使用re-index函数来实现。
此外，BioDrive还可以灵活地更改DNA和RNA序列的名称。在将序列注册到系统中这样的场景中，这个特性被证明是非常宝贵的。如果您收到注册ID的命中，BioDrive允许您将号码更新为相应的注册ID。这种无缝集成确保了序列的可追溯性。
BioDrive历史记录显示您在特定的BioDrive实验中所做的一切。每次加载序列、生成序列或进行对齐时，它都被捕获。
Arxpan BioDrive:满足您所有分子生物学需求的单一解决方案
通过高级搜索，您可以选择是否要搜索线性序列、圆形序列或两者都要搜索。同样，您可以选择是否搜索DNA序列、RNA序列或两者都搜索。另一种选择是选择是否要搜索核苷酸序列、氨基酸序列、引物或注释功能。
该系统可以在所有BioDrive实验中搜索特定的序列或DNA注释特征。例如，如果你正在寻找含有T7启动子的DNA序列，你可以很容易地找到使用这个特定序列的实验。
BioDrive是一种多功能的解决方案，用于可视化，模拟和记录您的分子生物学过程。Arxspan BioDrive能够简化各种分子生物学任务，从数据输入到分析。
即将推出的Arxspan BioDrive版本将引入几个新功能和增强功能。这些更新，像我们的应用程序，将定期改进。即将推出的功能包括直接从NCBI中检索序列，放大和缩小迷你地图，分屏和虚拟凝胶。更多细节将很快公布。
更多信息，请访问我们的Arxspan网站。浏览SciY网站了解我们姐妹公司的详细信息。
在我们的网站上，您可以随时了解与Arxspan和其他SciY应用程序和服务相关的新闻、活动和即将举行的网络研讨会。有关实时更新，请在社交媒体平台上关注我们。
我们建议下载桌面版的BioDrive。可以免费试用，但不需要激活码，只能使用7天。延长试用，请发送电子邮件Arxspan支持。
关于演讲者
Arxspan是一家基于云的科学信息工具的全球提供商，成立于2011年。我们的使命是为全球客户提供尖端的技术解决方案，我们通过同年发布的多租户云ELN实现了这一目标。我们的ELN提供企业级功能集，旨在支持小型生物技术初创企业以及全球制药公司。
2013年，Arxspan与多家客户合作，发布了集成的注册模块，这已经改变了行业的游戏规则。2017年，我们发布了工作流模块，使公司与其外部合作者之间的化合物/生物需求和实现紧密协调。我们的最新产品Data Publisher的推出是为了简化Arxspan与其他企业、传统和人工智能数据平台的集成。
今天，Arxspan提供了一个全面的企业信息学套件，包括ELN，化学和生物注册，化学和生物库存，以及分析数据管理，具有系统范围的搜索和报告功能。我们的客户和用户遍布北美、亚洲、印度和欧洲。我们将继续为快速增长的客户群部署世界一流的平台、工具、服务和一流的支持。
2019年，Bruker Biospin收购了Arxspan作为战略平台，为客户提供基于saas的企业工具。此次收购为我们提供了必要的资源和支持，以确保我们未来的持续成功。
我们很高兴地宣布推出我们的最新产品BioDrive，这是一个基于云的平台，旨在简化生物数据的管理。BioDrive为管理和共享数据提供了全面的解决方案，包括基因组数据、蛋白质组学数据和生物测定数据。它旨在满足生物技术和制药公司以及学术机构和研究组织的需求。
此外，我们很高兴地宣布我们的化学和Reg模块的最新更新。这些更新包括改进数据管理、简化工作流程和增强协作的新特性和功能。有了这些更新，我们将继续为客户提供他们需要的工具，以加快他们的研究和开发工作。
在Arxspan，我们致力于提供创新的解决方案，使客户能够实现他们的目标。我们期待着继续服务我们的客户，并为他们提供最好的工具和支持。
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