oncotarget发表了“肺癌模型细胞系NCI-H23的比较微粒体蛋白质组学揭示了3D和2D培养细胞分子谱的明显差异”，报道称，为了确定这两种不同培养条件下的表型差异，这些作者对3D和2D培养的非小细胞肺癌模型细胞系NCI-H23的膜片段进行了比较蛋白质组学分析。
该分析揭示了1166种蛋白质以培养依赖性方式调节的图谱，包括细胞表面CD分子子集的差异调节。他们证实CD99、CD146和CD239在3D培养中独占表达。
2019年，美国癌症协会报告称，美国有142670人死于肺癌。肺癌对男性和女性的影响相同，总体5年生存率为19%。组织学上，80-85%的病例属于非小细胞肺癌。最常见的非小细胞肺癌是肺腺癌。
尽管进行了大量的研究和经济投资，但大约95%的肺癌新药最终在临床试验中失败。人类癌细胞系的贴壁二维体外培养是肺癌药物开发和发现的主要临床前测试模型。然而，在实体瘤中，癌细胞在三维环境中生长。这使得2D培养的细胞无法真正再现其先天3D环境中发生的自然增殖、迁移和/或药物渗透。
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为了克服这一缺点，三维癌细胞培养被认为是一种更准确/相关的临床前测试模型，不仅在生物力学上，而且在基因组、蛋白质组和代谢组水平上。这种方法还为临床前图谱的开发创造了一条途径，该图谱描绘了在2D和3D中生长的细胞系的分子谱，这是准确监测药物开发所迫切需要的信息。当代基于ms的蛋白质组学是一项强有力的技术，能够揭示蛋白质水平表达/调节的变化以及与临床前药物评估相关的翻译后修饰的变化。
此外，在2D和3d培养中生长的非小细胞肺癌细胞系膜蛋白质组的差异分子表型仍然缺失。
Blonder研究小组在他们的肿瘤靶研究输出中得出结论，NCI-H23细胞含有KRas4BG12C纯合突变体，可以作为临床前非小细胞肺癌模型，用于检测与G12C KRas4B突变体第12位半胱氨酸结合的等位基因特异性共价抑制剂。重要的是，目前的方法允许对KRasWT和KRasG12C突变体调控的变化进行直接的蛋白形式和等位基因特异性定量，并且可以很容易地用于定量对等位基因特异性共价抑制剂或任何其他影响Ras表达的治疗性化合物的反应。
散弹枪蛋白质组学也适用于Ras亚型的绝对无抗体定量，使用合成的重亚型特异性色氨酸标准，用于lc - ms平行反应监测，这些作者先前描述了在复杂膜蛋白混合物中靶向异向性和多向性逆转录病毒受体1。
